O Lubaantun usłyszano po raz pierwszy w 1875 roku, choć początkowo
miejsce to znane było jako „Ruiny Río Grande”. W 1903 roku dotarł tam Thomas
Gaan, przygotował pierwszy plan miasta i to on, w 1924 roku, zmienił nazwę na Lubaantun. W 1915 roku R.E.W. Merwin z
Muzeum Peabody Uniwersytetu Harvarda rozpoczął prace wykopaliskowe, skupiające
się przede wszystkim na oczyszczeniu miejsca i sporządzeniu dokładniejszej
mapy.
Jedenaście lat później ekspedycja
z ramienia British Museum zajęła się klasyfikacją budowli Lubaantun, a bardziej rozległe prace, w ramach połączonego projektu
Uniwersytetów Cambridge i Harvarda, podjęto w 1970 roku pod kierunkiem Normana
Hammonda. W latach 1998-99 realizowano natomiast projekt archeologiczny
sponsorowany przez rząd Belize i Unię Europejską, na którego czele stanęli Juan
Luis Bonor i John Morris.

